청계천에 33종의 물고기가 서식하는 것으로 나타났다. 2005년 청계천이 복원된 후 가장 다양한 어종이 관찰된 것으로, 민물조개에 알을 낳는 떡납줄갱이도 최근 새롭게 발견됐다.